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2014年，廣州天河檢驗檢疫局在廣九直通車口岸共查驗出入境旅客380.5萬人次，開展醫學排查915人次，流行病學調查531人次，采樣460人次，檢出陽性病例121例，傳染病檢出率同比增長168.9%。
據悉，檢出的陽性病例包括甲型H1N1流感26例，季節性甲流41例，乙流30例，其他呼吸道疾病病原體11例，輸入性惡性瘧疾及人偏肺病毒陽性8例，冠狀病毒及蠟樣芽胞桿菌感染病例5例。
檢驗檢疫部門表示，作為全中國最大的一類鐵路客運口岸，在國際傳染病疫情連年暴發的形勢下，天河檢驗檢疫局防控任務異常嚴峻。
天河口岸傳染病檢出率大幅攀升的原因有三：一是廣九直通車多年努力打造品牌跨境列車，乘客人數不斷增加，2014年出入境人數比2013年(362.8萬人次)增加了4.9%；二是部分入境旅客旅行史比較復雜，到過傳染病疫區的旅客增多，攜帶傳染病的機率增加；三是檢驗檢疫部門嚴把口岸關，加強業務培訓、完善查驗儀器設備、增加紅外成像測溫儀調校次數、調整和增調醫學專業人員充實旅檢隊伍，并做到分類查驗，以旅客體溫篩查一個不漏，發熱旅客的流行病學調查一個不漏，發熱旅客的跟蹤診療一個不漏為目標，全面提升行政執法能力，提高通關速度。
