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9月21日0時至24時，31個省(自治區、直轄市)和新疆生產建設兵團報告新增確診病例41例。其中境外輸入病例25例(云南14例，上海6例，福建2例，廣東2例，四川1例)，2例由無癥狀感染者轉為確診病例(福建1例，四川1例)。本地病例16例(福建13例，其中廈門11例，莆田2例；黑龍江3例，均在哈爾濱)。沒有新的死亡病例。新增疑似病例2例，均為境外輸入(均在上海)。
當日新增治愈出院病例37例，解除醫學觀察的密切接觸者797人，重癥病例較前一日增加2例。
境外輸入確診病例532例(其中重癥病例5例)，疑似病例4例。確診病例8868例，出院病例8336例，無死亡病例。
截至9月21日24時，據31個省(自治區、直轄市)和新疆生產建設兵團報告，現有確診病例984例(其中重癥病例14例)，治愈出院病例90231例，死亡病例4636例，確診病例95851例，疑似病例4例。累計追蹤密切接觸者1182333人，尚在醫學觀察的密切接觸者16770人。
31個省(自治區、直轄市)和新疆生產建設兵團報告新增無癥狀感染者9例(均為境外輸入)；當日確診2例(均為境外輸入)；當日解除醫學觀察14例(均為境外輸入)。尚在醫學觀察的無癥狀感染者342人(境外輸入333人)。
香港、澳門和臺灣共報告28，381例確診病例。其中，香港特別行政區12166例(出院11878例，死亡213例)，澳門特別行政區63例(出院63例)，臺灣省16152例(出院13742例，死亡840例)。
