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當飛利肝寧膠囊的主要成份水飛薊素是低毒性的藥物，不過長期或不恰當服用也會產生一些不良的反應，如食欲不振、惡心嘔吐、頭暈、腹瀉等。另外，長期服用水飛薊素還會讓患者對其產生依賴性，不能隨意停藥，且一旦停藥后容易造成病情反復的現象。
為了盡量避免副作用的出現，患者服用當飛利肝寧膠囊應該注意以下幾點：
1.對本品過敏者者禁止使用本藥。
2.一定要到正規的大型的肝病醫院做全面的檢查，然后根據精確的檢查結果，并結合醫生的指導進行合理的用藥與治療，以便能夠早日恢復健康。
3.要注意該藥的配伍禁忌，避免因為藥物相互作用而產生的不良反應。如有使用其他藥物，需要咨詢醫生可否用藥。
如正在服用其他藥品，使用本品前請咨詢醫師或藥師。
